À ce que je sais, LyX produit les mêmes documents que LaTeX mais LyX est WYSIWYG : on ne tape pas de fichier source, on a des menus, des icônes, etc.

LyX n'est pas Wysiwyg ; il est en fait Wysiwym (what you see is what you mean).
Quand on tape un texte en LyX, on tape en fait une sorte de brouillon. Une fois exporté en pdf, ps ou autre, ou simplement lors de l'impression, le texte est complètement mis en page sans intervention de l'auteur.

La version 2.0.0 vient de sortir. Je vous recommande de l'essayer.

Non, on n'écrit pas en cliquant sur des icônes.

Exemple :

A la suite d'un texte saisi au clavier, on tape Ctrl+m pour insérer une expression mathématique, ou Ctrl+M pour en insérer une en centrant dans la page.

Ensuite, on tape en code LaTeX, jusqu'à la fin de l'expression.
En passant à la ligne, on revient en mode texte.

Les titres, sections, sous-sections, sous-sous-sections, citations, numéros d'équations, notes en bas de page, sont gérés automatiquement par LyX.