Bonjour à tous
J'aimerais avoir votre avis
Je veux faire une analyse statistique de la fréquence des mutations dans trois cancers différentes les données sont comme suit
Mutations, sein, ovaire, bouche
A16G , 1, 1, 1
T146C, 5, 7, 6
G143A, 2, 6, 9
A189G, 10, 17, 4
C150T, 3, 8, 5
T152C , 1, 1, 3
etc.
Je veux connaître le cancer le plus impacté par les mutations en me basant sur les fréquences
J'ai essayé de faire un chi2 test mais j'ai un message d'erreur
'tous les valeurs de 'x' doivent être positives nulles et définis'
Est ce que vous pouvez m'aider.
Salut
Pour réaliser un test du chi2 d'indépendance il faut connaître les effectifs et qu'ils soient supérieurs ou égaux à 5
Ton tableau donne des pourcentages
Il faut avoir des effectifs
Si cet exercice ne les fournit pas prends par exemple un effectif total de 500
oups je n'ai pas vu ton etc.
je pensais que le total faisait 100
Dans ce cas multiplie tes donnees par 5 par exemple
tu as peut etre acces aux aux effectifs ?
Bonjour,
il me semble dangereux d'inventer des effectifs.
Pour donner un exemple, imaginons que l'on veut savoir si une pièce est équilibrée ( pile ou face ).
On obtient 75% de pile.
Si c'est 3 piles sur 4 lancers on ne peut rien dire.
Si c'est 300 piles sur 400 lancers on est presque certain que pile est plus probable que face.
evidemment il ne s'agit pas de modifier l'exercice s'il est donne ainsi
ou bien l'exercice est fictif et il faut l'adapter pour faire un chi2
ou bien il s'agit d'une etude concrete et on doit pouvoir acceder aux effectifs et voir si un chi2 est judicieux
Rane1094 nous dira ce qu'il en est
Désolé j'ai pas été très clair
Les données ne sont pas des pourcentages mais des fréquences (c'est le nombre de fous qu'une mutations a été trouvée) je peux bien sûr faire des pourcentage mais j'aurais des nombre comme( 0,25 ; 0,50 etc..)
Et en plus c'est pas un exercice j'ai généré mois même ces données après avoi analysé des séquences issues de trois cancers.
Je pense que vous comprenez un peux mieux.
frequence ou pourcentage c'est la meme chose
Dans ton etude il s'agit donc d'effectifs
Faire un test statistique avec autant de faibles effectifs n'est pas realiste
L'avis d'un oncologue serait plus concluant
On a bien envie de dire que la mutation A189G est significativement presente dans les cancers du sein ou des ovaires
Plaquer des stats à toute force n'est peut etre pas la bonne idee
Peut etre reprendre l'etude de sorte qu'on ait au plus 1 ou 2 classes d'effectifs inferieur à 5
Un autre intervenant pourrait nous dire quel type de test serait possible avec de tels effectifs ?
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